Процессуальные издержки по уголовному делу возмещаются как за счет средств федерального бюджета, так и взыскиваются с участников уголовного судопроизводства. Все зависит от того, какое решение выносится по итогам предварительного расследования и судебного рассмотрения уголовного дела (признается подсудимый невиновным или виновным в совершении преступления, в особом или общем порядке рассматривается уголовное делои т.д.). Взыскание процессуальных издержек осуществляется исключительно в доход государства, а не в пользу каких-либо учреждений или организаций.

Процессуальные издержки в доход государства (вид дохода «Доходы, поступающие в порядке возмещения федеральному бюджету расходов, направленных на покрытие процессуальных издержек)» закреплен за администратором доходов бюджета ФСИН России в рамках производств по удержанию из заработной платы осужденных в случаях, предусмотренных законодательством Российской Федерации (статьи 44, 60, 107 УИК РФ), а именно, если осужденному назначено наказание, связанное с лишением свободы, исправительные, принудительные и обязательные работы). Процессуальные издержки в доход государства (вид дохода «Доходы, поступающие в порядке возмещения федеральному бюджету расходов, направленных на покрытие процессуальных издержек)» судебным графам, изложенным в порядке ст.118 УПК РФ, ст.122, 123 КАС РФ, ст.105, 106 ГПК РФ (виды доходов «Судебные штрафа (денежные взыскания), налагаемые судами в случаях, предусмотренных УПК РФ, КАС РФ, ГПК РФ), судебным штрафам, назначенным в качестве меры уголовно-правового характера по инициативе суда или по результатам рассмотрения ходатайства органов дознания (вид дохода «Судебные штрафа (денежные взыскания), налагаемые судами в случаях, предусмотренных УК РФ»), уголовным штрафам, как основной (дополнительный) вид наказания, установленным главами 16 (часть 1 статьи 115, статья 116.1), 17 (часть 1 статьи 128.1), 20 (статья 157), 22 (статья 177), 31 (часть 1 статьи 294, статья 297, часть 1 статьи 311, статья 312, статья 315) УК РФ (вид доходов «Штрафы, установленные главами 16.17,20,22,31 УК РФ), закрепленным за администратором доходов бюджета ФССП России.